Eliška Baťová je odbornou asistentkou pro starší knižní kulturu Ústavu informačních studií a knihovnictví FF UK. Vyučuje zejména dějiny knihtisku. Ve své vlastní odborné činnosti se zaměřuje se na výzkum pramenů české duchovní písně a chorálního repertoáru 15. a 16. století a zabývá se rovněž širším kontextem kancionálů jako specifické součásti knižní kultury. Zajímá ji otázka konfesní podmíněnosti knižní kultury pozdního středověku a raného novověku, vzájemné vlivy rukopisných a tištěných médií v prvním století existence knihtisku a vztah mezi jejich materialitou a performativitou. Je autorkou nebo spoluautorkou samostatných i kolektivních monografií o kancionálové produkci českých bratří a utrakvistů, článků v odborných periodicích, odborného aparátu k Evangelickému zpěvníku, recenzí, textů k výstavám a koncertních dramaturgií.

Je absolventkou magisterského studia Ústavu hudební vědy FF UK (Mgr. a PhDr.) a doktorského studia na Ústavu informačních studií a knihovnictví FF UK. Má bohaté pedagogické zkušenosti díky svému již přes dvacet let trvajícímu působení na základních uměleckých školách. Jako výzkumná nebo odborná pracovnice působila dříve v Nadaci pro dějiny kultury ve střední Evropě a v Ústřední církevní kanceláři Českobratrské církve evangelické. Je úspěšnou řešitelkou individuálního projektu GAČR s názvem Hymnologické koncepce Jana Blahoslava a Jana Augusty a spolupracovala také na projektu Staré mýty, nová fakta: české země v centru hudebního dění 15. století (GAČR EXPRO).